Кожного дихання вже немає, що призвело до вдосконалення легких як єдиного органу дихання і до участі в диханні грудної клітки.

Кровоносна система також характеризується подальшим вдосконаленням. Серце трикамерне, шлуночок розділений неповною перегородкою на венозну та артеріальну половини. Справжнє чотирикамерне серце зустрічається лише у крокодилів, у яких правий і лівий шлуночок повністю відокремлені, тобто розділені тонкою перегородкою. У плазунів два кола кровообігу, але вони ще не повністю розділені (навіть у крокодилів), внаслідок чого кров ще частково змішується в спинний аорті (як і у земноводних).

Видільна система представлена парою вторинних тазових нирок (метанефрос) і парою сечоводів, що впадають в клоаку, в яку одночасно відкривається і сечовий міхур. Особливість будови нирок полягає в тому, що при зменшенні відносної фільтраційної площі клубочків збільшена протяжність канальців. Осморегулірующая функція нирок майже не виражена, тому що в тілі плазунів немає надлишку води.

Нервова система також характеризується прогресивними рисами. Зокрема, головний мозок має риси, характерні для мозку наземних тварин. У довгастому мозку сформований вигин, який зазвичай зустрічається у всіх амніот. Сформовано також зачаток кори великих півкуль мозку. Від головного мозку відходять черепномозкової нерви (12 пар). Характерно досконаліше зір за рахунок можливості зміни кривизни кришталика. У війкового тілі розвинена поперечно-смугаста мускулатура. В органах слуху збільшена равлик, в слуховий капсулі є другим отвір. Органи нюху відрізняються великою розвиненістю носових раковин, розвитком вторинного неба. Дуже розвинений Якобсоном орган, який забезпечує сприйняття запаху видобутку.

Плазуни володіють усіма ендокринними залозами, характерними для вищих тварин. Температура тіла плазунів залежить від середовища.

Плазуни роздільностатеві, характеризуються вираженим статевим диморфізму. Одні плазуни є яйцекладущімі, інші-живонароджених. Широко розвинене яйце-живородіння. Пол генетично детермінується лише у деяких видів ящірок, можливо, у всіх змій. Однак у багатьох плазунів підлогу детермінується не генетично, а чинниками зовнішнього середовища, зокрема, температурою. Наприклад, у багатьох видів черепах дію високих температур супроводжується появою на світ лише самок, низьких температур - тільки самців. Зворотне положення зазначено у крокодилів та деяких видів ящірок.

Тварин цього класу підрозділяють на загони Лускаті (Sguamata), Черепахи (Chelonia), Крокодили (Crocodylia) і Первоящери, або Клювоголовие (Prosauria, або Rhyncocephalia).

Значення змій визначається тим, що багато видів мають отруйними залозами і зубами. Господарське значення визначається цінністю їх шкіри. Черепахи мають господарське значення, оскільки деякі види і їхні яйця їстівні. Крокодили теж мають господарське значення, але небезпечні як хижаків, що нападають на людину.

Плазуни входять в головний стовбур еволюції, будучи предкової формами птахів і ссавців. Найдавнішими плазує були котілозаври, які походять від стегоцефалов в кам'яновугільному періоді. Розвиток котілозавров дало початку декільком еволюційним гілкам (іхтіозавра, плезіозавра). Як сліпий бічний групи відділилися анапсіди, сучасними нащадками яких є черепахи, що виникли в тріасі.

Важливою подією в еволюції плазунів була поява малих плазунів (діапсід), череп яких мав два отвори в скроневої області.