Перший бактеріальний вірус, ймовірно, виник, коли у плазмід з'явився ген (гени), що кодує білок (білки) капсида.

Однак між бактеріальними вірусами і плазмідами типу факторів перенесення все ж є дуже важливі відмінності.

По-перше, фактори переносу, перебуваючи в бактеріях, контролюють на їх поверхні синтез спеціалізованих структур пилі і, внаслідок чого бактеріальні клітини мають кон'ю-гативностью, тобто здатність діяти в якості генетичних донорів. Бактеріальні віруси цією здатністю не володіють.

По-друге, чинники перенесення здатні передаватися від клітини до клітини в результаті клітинних контактів. Спосіб інфіцірова-ня бактерій вірусами є зовсім іншим і закінчується фаголізісом інфікованої бактеріальної клітини.

По-третє, фактори перенесення здатні мобілізувати бактеріальну хромосому на перенесення від однієї клітини до іншої, причому також у результаті клітинних контактів. Бактеріальні віруси цією здатністю не володіють. Що ж до спроможності окремих бактеріальних вірусів переносити сегменти бактеріальної хромосоми від одних клітин до інших, то механізм такого генетичного обміну (трансдукції) не пов'язаний з клітинними контактами.

По-четверте, сайти включення окремих плазмід в хромосому більш-менш різноманітні, тоді як інтеграція профагов частіше відбувається тільки в певних сайтах хромосоми.

Нарешті, плазміди не мають здатність ціалізуватися бактерії, тоді як всі фаги, включаючи також помірні (в автономному стані), завжди викликають лізис бактерій. Наявність перерахованих відмінностей можна пояснити придбанням специфічних перетворень бактеріальними вірусами і плазмідами в ході дівергентной еволюції.

Якщо в поясненнях походження бактеріальних вірусів намітився безсумнівний успіх, то походження вірусів тварин і рослин не має задовільних пояснень, хоча їхнє походження теж іноді пов'язують з плазміди.

Обговорюючи походження вірусів, не можна не привернути увагу до одного важливого моменту, полягає в тому, що віруси надавали і впливають на еволюцію організмів, в яких вони паразитують.